Il Perdiguero de Burgos è stato allevato come razza di cane da ferma in Spagna per secoli, ma la sua origine originaria è sconosciuta. Si ritiene che il Perdiguero de Burgos sia un incrocio tra il Sabueso Español e il Pachon Iberico.
Nel 1911 la razza fu inclusa nel registro spagnolo della razza. Dal 1936, il Perdiguero de Burgos subì la stessa sorte di molte altre razze canine: la razza fu quasi spazzata via durante la Guerra Civile Spagnola e la Seconda Guerra Mondiale. Fu solo nel 1950 che il Perdiguero de Burgos fu allevato di nuovo.
Oggi in Germania, invece, il Perdiguero de Burgos è piuttosto raro.