Исследователи считают, что самоедские лайки живут рядом с человеком уже около трех тысяч лет, причем практически в неизменном виде, так как ареал их обитания ограничен, а смешение с другими собаками было невозможно по объективным причинам.
Свое название порода получила от названия кочевых племен северных районов Урала и Сибири, ныне известных как ненцы. Эти народности жили обособленно от окружающего мира и были самодостаточны, «самообъединены» — отсюда и название.