O Perdiguero de Burgos foi criado como unha raza de can apuntador en España durante séculos, pero descoñécese a súa orixe orixinal. Crese que o Perdiguero de Burgos é un cruce entre o Sabueso Español e o Pachon Ibérico.
En 1911 a raza foi incluída no rexistro español de razas. A partir de 1936, o Perdiguero de Burgos corre a mesma sorte que moitas outras razas de cans: a raza foi case exterminada durante a Guerra Civil Española e a Segunda Guerra Mundial. Non foi ata 1950 cando se volve a criar o Perdiguero de Burgos.
Hoxe en Alemaña, porén, o Perdiguero de Burgos é bastante raro.