Dès le Moyen Âge, la race hollandaise était utilisée comme chien de garde, chien de ferme ou chien de chasse. A cette époque, il avait été utilisé notamment pour la chasse aux loutres.
Vers 1950, la race était presque éteinte jusqu'à ce qu'une femme frisonne commence à les élever et assure ainsi la survie de la race. La plupart des Wetterhouns se trouvent aux Pays-Bas.
Fait : La race Wetterhoun est à peine connue en dehors des Pays-Bas. Ce n'est que dans quelques autres pays européens qu'il y a des personnes atteintes de Wetterhouns.
En 1989, la FCI a officiellement reconnu le Wetterhoun comme une race de chien. Il appartient au groupe des retrievers, des chiens de recherche et des chiens d'eau.