Pekingeser er en af de ældste racer i verden, hvilket er bekræftet af genetiske undersøgelser. Ifølge videnskabsmænd er disse hunde mindst 2000 år gamle. Der er en smuk kinesisk legende, meget gammel, sandsynligvis ikke mindre gammel end selve Pekingeser-racen.
Og det lyder sådan her: engang blev en løve forelsket i en abe, men løven er enorm, og aben er meget lille. Løven kunne ikke forlige sig med denne situation og begyndte at tigge Buddha om at gøre ham lille – passende i størrelse til en abe. Således dukkede pekingeseren ifølge legenden op, som har en lille størrelse og et løvehjerte.
Igennem deres historie, indtil den sidste kejser af Kina, var Pekingeserne udelukkende den kejserlige families prærogativ. Ingen, ikke engang det højeste aristokrati i Kina, havde ret til at have disse hunde. I paladset boede de hver for sig, i specielle lejligheder, de blev strengt bevogtet, desuden blev det forbudt for almindelige mennesker selv at se på disse hunde.