Perdiguero de Burgos đã được lai tạo như một giống chó chỉ điểm ở Tây Ban Nha trong nhiều thế kỷ, nhưng nguồn gốc ban đầu của nó vẫn chưa được biết rõ. Người ta tin rằng Perdiguero de Burgos là con lai giữa Sabueso Español và Pachon Iberico.
Năm 1911, giống chó này đã được đưa vào sổ đăng ký giống chó Tây Ban Nha. Từ năm 1936, Perdiguero de Burgos chịu chung số phận như nhiều giống chó khác: giống chó này gần như bị xóa sổ trong Nội chiến Tây Ban Nha và Thế chiến thứ hai. Mãi đến năm 1950, Perdiguero de Burgos mới được nhân giống trở lại.
Tuy nhiên, ngày nay ở Đức, Perdiguero de Burgos khá hiếm.