ดวงตาสีฟ้าสดใสของฮัสกี้นั้นสะดุดตา มีเพียงไม่กี่สายพันธุ์สุนัขอื่นๆ เช่น Australian Shepherd และ Collie เท่านั้นที่สามารถมีตาสีฟ้าได้ สำหรับไซบีเรียน ฮัสกี้ นักวิจัยได้พิจารณาแล้วว่าสีของพวกมันมักจะนำไปสู่อะไร ตามนี้มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับการทำซ้ำของภูมิภาคเฉพาะบนโครโมโซม 18 จีโนมของสุนัขมีการกระจายไปทั่วโครโมโซมทั้งหมด 78 โครโมโซมมนุษย์ 46 ตัวและแมว 38 ตัว
สายพันธุ์ต่างๆ ของยีน เช่น ปัจจัยที่เรียกว่าเมิร์ลที่ทำให้เกิดดวงตาสีฟ้าในสุนัขบางสายพันธุ์ เป็นที่ทราบกันดีอยู่แล้ว แต่ยีนเหล่านี้ไม่ได้มีบทบาทในไซบีเรียน ฮัสกี้ ทีมที่นำโดย Adam Boyko และ Aaron Sams จาก Embark Veterinary ในเมืองบอสตัน รัฐแมสซาชูเซตส์ ซึ่งเป็นซัพพลายเออร์ของการตรวจดีเอ็นเอของสุนัข ได้รวมสุนัขมากกว่า 6,000 ตัวที่มีสีตาต่างกันในการวิเคราะห์จีโนม
นักวิจัยรายงานในวารสาร PLOS Genetics ว่าบริเวณสองเท่าของโครโมโซมอยู่ใกล้กับยีน ALX4 ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาดวงตาในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม อย่างไรก็ตาม ไม่ใช่ว่าฮัสกี้ทั้งหมดที่มีความแตกต่างทางพันธุกรรมจะมีตาสีฟ้า ดังนั้นปัจจัยทางพันธุกรรมหรือสิ่งแวดล้อมอื่นๆ ที่ไม่เคยรู้จักมาก่อนจึงต้องมีบทบาทด้วย บ่อยครั้งที่สัตว์มีตาสีน้ำตาลข้างหนึ่งและอีกข้างสีน้ำเงิน