Пекинезер је једна од најстаријих раса на свету, што потврђују и генетске студије. Према научницима, ови пси су стари најмање 2000 година. Постоји прелепа кинеска легенда, веома древна, вероватно не мање древна од саме расе пекинезера.
И звучи овако: једном се лав заљубио у мајмуна, али лав је огроман, а мајмун врло мали. Лав није могао да се помири са оваквим стањем ствари и почео је да моли Буду да га начини малог – величине за мајмуна. Тако се, према легенди, појавио пекинезер, који има мале величине и лавље срце.
Током своје историје, све до последњег цара Кине, пекинезер је био искључиво прерогатив царске породице. Нико, чак ни највиша аристократија Кине, није имала право да има ове псе. У палати су живели одвојено, у посебним становима, били су строго чувани, штавише, обичанима је било забрањено чак и да гледају ове псе.