Ekosistem je skupnost rastlin in živali, ki živijo na določenem mestu. Včasih so del tega tudi ljudje. Del ekosistema je tudi kraj oziroma habitat. Imenuje se biotop. Grška beseda "eko" pomeni "hiša" ali "gospodinjstvo". Beseda "sistem" označuje nekaj, kar je med seboj povezano. Naravoslovna veda, ki opisuje ekosisteme, je ekologija.
Kako velik je ta življenjski prostor in kaj mu pripada, določajo ljudje, predvsem znanstveniki. Vedno je odvisno od tega, kaj želite izvedeti. Gnijočemu štoru ali ribniku lahko rečete ekosistem – lahko pa tudi celotnemu gozdu, v katerem sta štor in ribnik. Ali travnik skupaj s potokom, ki teče po njem.
Ekosistemi se skozi čas spreminjajo. Ko rastline odmrejo, na tleh tvorijo humus, na katerem lahko rastejo nove rastline. Če se živalska vrsta močno razmnožuje, morda ne najde dovolj hrane. Potem bo teh živali spet manj.
Vendar pa je ekosistem mogoče motiti tudi od zunaj. To se na primer zgodi s potokom, ko tovarna zlije umazano vodo v zemljo. Od tam lahko pride strup v podtalnico, od tam pa v potok. Živali in rastline v potoku lahko poginejo zaradi strupa. Drug primer je strela, ki udari v gozd in zažge vsa drevesa.