Zgodovina pasme pekinezer je še vedno skrita pod tančico skrivnosti. Datuma rojstva pasme ni mogoče določiti niti približno. Zato je bil izvor pekinezerov poraščen z legendami in miti.
Ena od legend o zgodovini pasme pekinezer pravi, da se je princ zaljubil v preprosto dekle. Toda njena lepota je očarala tudi zlobnega čarovnika. Ko je lepotica zavrnila trditve čarovnika, jo je spremenil v lotosov cvet, princa pa v veverico. Vendar njuna ljubezen ni izginila. Veverica je nežno skrbela za rožo. Ko je to videl, se je Buda usmilil in blagoslovil zaljubljence.
Plod ljubezni je bil pekinezer, katerega košati rep spominja na veverico, njegov značaj in postava pa sta nežnost in krhkost lotosa.