Perdiguero de Burgos bol chovaný ako plemeno stavacieho psa v Španielsku po stáročia, ale jeho pôvodný pôvod nie je známy. Verí sa, že Perdiguero de Burgos je kríženec medzi Sabueso Español a Pachon Iberico.
V roku 1911 bolo plemeno zaradené do španielskeho registra plemien. Od roku 1936 stihol Perdiguero de Burgos rovnaký osud ako mnoho iných plemien psov: plemeno bolo takmer vyhubené počas španielskej občianskej vojny a druhej svetovej vojny. Až v roku 1950 bol Perdiguero de Burgos znovu vyšľachtený.
Dnes je však v Nemecku Perdiguero de Burgos skôr vzácnosťou.