Да. Однако у большинства представителей породы это не особо выражено и часто им можно пренебречь. Тем не менее, чихуахуа есть и остается собакой, и некоторые инстинкты никогда не могут быть полностью искоренены.
Соответственно, есть и экземпляры самой маленькой породы в мире, которые бегают и охотятся на грызунов, птиц, кроликов или даже кошек. Преследуемое животное может быть ранено или убито.
Если в одном домашнем хозяйстве есть другие животные, требуется осторожность и хорошая наблюдательность.