Perdiguero de Burgos był hodowany w Hiszpanii jako rasa wyżłów od wieków, ale jego pierwotne pochodzenie jest nieznane. Uważa się, że Perdiguero de Burgos jest krzyżówką Sabueso Español i Pachon Iberico.
W 1911 roku rasa została wpisana do hiszpańskiego rejestru ras. Od 1936 roku Perdiguero de Burgos spotkał ten sam los, co wiele innych ras psów: rasa ta została prawie całkowicie zniszczona podczas hiszpańskiej wojny domowej i drugiej wojny światowej. Dopiero w 1950 r. ponownie wyhodowano Perdiguero de Burgos.
Jednak dziś w Niemczech Perdiguero de Burgos jest raczej rzadkie.