Pojawienie się Goldendoodles było intencją hodowców, aby wyhodować taką rasę, której sierść nie powodowałaby alergii, a predyspozycje do nieprawidłowości genetycznych i linienia byłyby zminimalizowane.
Pierwsze pokolenie rasy zostało wyhodowane w 1990 roku w wyniku skojarzenia pudla i golden retrievera, a nazwę zapożyczono z przykładu rasy Labradoodle. Ku powszechnemu ubolewaniu hodowców, w wyniku takiego krycia zwyciężył tylko jeden z „rodziców”, a opis i cechy szczeniąt z tego samego miotu nie pasowały. Kolejne eksperymenty hodowców ujawniły, że cechy szczeniąt urodzonych w wyniku skrzyżowania Golden Retrievera z Golden Retrieverem lub Pudlem mają lepsze cechy niż szczenięta uzyskane w pierwszym pokoleniu.
W wyniku nieustannych eksperymentów w 2002 roku wyhodowano nowy miniaturowy gatunek tej rasy, uzyskany w wyniku skojarzenia Golden Retrievera z Toy Pudlem. Ale w tej chwili rasa ta nie zdobyła statusu „psa kieszonkowego”. Ponadto, pomimo wszystkich wysiłków hodowców, rasa ta nie jest obecnie uznawana przez kluby kynologiczne, ale North American Goldendoodle Association z siedzibą w Ameryce Północnej przyczynia się do jej standaryzacji.