Pojawienie się Goldendoodles było intencją hodowców, aby wyhodować taką rasę, której sierść nie powodowałaby alergii, a predyspozycje do nieprawidłowości genetycznych i linienia byłyby zminimalizowane.
Pierwsze pokolenie rasy zostało wyhodowane w 1990 roku w wyniku skojarzenia pudla i golden retrievera, a nazwę zapożyczono z przykładu rasy Labradoodle. Ku powszechnemu ubolewaniu hodowców, w wyniku takiego krycia zwyciężył tylko jeden z „rodziców”, a opis i cechy szczeniąt z tego samego miotu nie pasowały. Kolejne eksperymenty hodowców ujawniły, że cechy szczeniąt urodzonych w wyniku skrzyżowania Golden Retrievera z Golden Retrieverem lub Pudlem są lepsze niż szczenięta uzyskane w pierwszym pokoleniu.