Perdiguero de Burgos telah dibiakkan sebagai baka anjing penunjuk di Sepanyol selama berabad-abad, tetapi asal usulnya tidak diketahui. Adalah dipercayai bahawa Perdiguero de Burgos adalah kacukan antara Sabueso Español dan Pachon Iberico.
Pada tahun 1911 baka itu dimasukkan ke dalam daftar baka Sepanyol. Dari tahun 1936, Perdiguero de Burgos menemui nasib yang sama seperti banyak baka anjing lain: baka itu hampir dihapuskan semasa Perang Saudara Sepanyol dan Perang Dunia Kedua. Ia tidak sehingga tahun 1950 bahawa Perdiguero de Burgos dibiakkan semula.
Hari ini di Jerman, bagaimanapun, Perdiguero de Burgos agak jarang berlaku.