מקורו של הדוג דה בורדו מתחיל במאה ה-14 כאשר המונח מסטיף הופיע לראשונה. זה הופך אותו לאחד מגזעי הכלבים העתיקים ביותר בצרפת. שם ניתן לאתר אותו אל האלנרהונד. באותה תקופה, הדוג דה בורדו שימש ככלב ציד או לשמירה על בתים.
תערוכת הכלבים הצרפתית הראשונה התקיימה בשנת 1863, בה הוצג הדוג דה בורדו לראשונה בשמו הנוכחי. עם זאת, הדוג דה בורדו סבל מאוד במהלך מלחמות העולם והיה מאוים גם בהכחדה לאחר מלחמת העולם השנייה. אולם למרבה המזל, הגזע מצא מומנטום חדש בשנות ה-1960.
לגזע הייתה הופעה תקשורתית קטנה בשנת 1989. שם הוא נראה בסרט Scott & Huutsch לצד טום הנקס.
עובדה מהנה: רוזן שהיה הבעלים של דוגו דה בורדו לציד תיאר בספרו שהם היו טובים יותר במעקב אחר טרף מאשר שלושה כלבים גרייהאונדים.