Björt blá augu Husky eru áberandi. Aðeins nokkrar aðrar hundategundir, eins og Australian Shepherd og Collie, geta líka haft blá augu. Hvað Siberian Huskies varðar, hafa vísindamenn nú komist að því hvað litarefni þeirra leiðir oft til. Samkvæmt þessu eru náin tengsl við fjölföldun tiltekins svæðis á litningi 18. Erfðamengi hunda dreifist á alls 78 litninga, 46 í mönnum og 38 í köttum.
Nokkur genaafbrigði, eins og hinn svokallaði merle þáttur sem veldur bláum augum í ákveðnum hundategundum, voru þegar þekkt, en þau gegna ekki hlutverki í Siberian Huskies. Teymi undir forystu Adam Boyko og Aaron Sams frá Embark Veterinary í Boston, Massachusetts, birgir DNA-prófa fyrir hunda, tók nú meira en 6,000 hunda með mismunandi augnlit í erfðamengigreininguna.
Tvöfaldað svæði litningsins er nálægt ALX4 geninu, sem gegnir mikilvægu hlutverki í þróun augna í spendýrum, að því er vísindamennirnir greina frá í tímaritinu PLOS Genetics. Hins vegar eru ekki allir Huskies með erfðaafbrigðið með blá augu, svo aðrir áður óþekktir erfða- eða umhverfisþættir hljóta einnig að gegna hlutverki. Oft hefur dýr annað brúnt auga og hitt blátt.