Perdiguero de Burgos hefur verið ræktaður sem hundategund á Spáni um aldir, en upprunalegur uppruna hans er óþekktur. Talið er að Perdiguero de Burgos sé kross á milli Sabueso Español og Pachon Iberico.
Árið 1911 var tegundin tekin upp í spænsku tegundaskrána. Frá 1936 hlaut Perdiguero de Burgos sömu örlög og margar aðrar hundategundir: tegundin var nánast útrýmt í spænska borgarastyrjöldinni og síðari heimsstyrjöldinni. Það var ekki fyrr en 1950 sem Perdiguero de Burgos var ræktaður aftur.
Í dag í Þýskalandi er Perdiguero de Burgos hins vegar frekar sjaldgæfur.