A Perdiguero de Burgos-t Spanyolországban évszázadok óta tenyésztik hegyes kutyafajtaként, de eredeti eredete ismeretlen. Úgy tartják, hogy a Perdiguero de Burgos a Sabueso Español és a Pachon Iberico keresztezése.
1911-ben a fajta bekerült a spanyol fajtajegyzékbe. 1936-tól a Perdiguero de Burgos ugyanarra a sorsra jutott, mint sok más kutyafajta: a fajta szinte kipusztult a spanyol polgárháború és a második világháború idején. Csak 1950-ben tenyésztették újra a Perdiguero de Burgost.
Ma Németországban azonban a Perdiguero de Burgos meglehetősen ritka.