A skót terrier valószínűleg rövid lábú és nagyon ragadozó vadászkutyák leszármazottja, amelyeket Skócia északnyugati részén, a Perthshire megye körüli Felföldön használtak elsősorban borzok, rókák és vadnyulak, valamint vidra vadászatára. Ezeknek az akkori nagyon izmos terriereknek valószínűleg valamivel hosszabb lábaik voltak, mint a mai skótoknak, ahogy a fajtát szeretettel ismerik.
#1 Bátornak és rettenthetetlennek mutatták magukat a jól megerősített zsákmányukkal szemben, de optikailag nem sok közös vonásuk volt a mai fajtastandardhoz.
A skót terrierhez hasonlóan a másik három rövidlábú terrier, a Cairn, a Skye és a West Highland White Terrier is valószínűleg ezekhez az eredeti skót vadászkutyákhoz nyúlik vissza.
#2 A 19. század közepén a skót Aberdeen városában megkezdődött egy külön terrier fajta célzott tenyésztése.
Már 1879-ben mutatták be először Angliában egy kutyakiállításon ezeket a kutyákat, akkoriban még zömében szálkás bundával. Kezdetben vita volt arról, hogy a Skóciából származó különféle terrierek közül melyik kaphatta meg a „skót terrier” elnevezést.
#3 A Skót Terrier Klub alapítója, Gordon Murray kapitány azonban 1882-ben érvényesülni tudott, és így az „aberdeen terrierből” végül „skót terrier” lett.
A Club for Terrier 1894-es németországi megalapítása végre megalapozta az új fajta tenyésztését ebben az országban is. 1906-ban az első kölykök „skót terrier” néven kerültek be a méneskönyvbe. A feltűnő külsővel rendelkező, többnyire koromfekete terrierből hamar igazi divatkutyává vált.