Istraživači vjeruju da samojedski haskiji žive uz čovjeka oko tri tisuće godina, i to u gotovo nepromijenjenom obliku, budući da je njihovo stanište ograničeno, a miješanje s drugim psima bilo je nemoguće iz objektivnih razloga.
Pasmina je dobila ime po imenu nomadskih plemena sjevernih regija Urala i Sibira, danas poznatih kao Neneti. Ove su nacionalnosti živjele odvojeno od okolnog svijeta i bile su samodostatne, "samoujedinjene" - otuda i naziv.