स्केनौज़र की उत्पत्ति स्वयं विश्वसनीय रूप से स्थापित नहीं हुई है। एक पीट कुत्ते से, अन्य कुत्तों की तरह, श्नौज़र की उत्पत्ति के बारे में थियोफिल स्टडीर का सिद्धांत, जिसके अवशेष III-IV सदियों ईसा पूर्व के हैं, आनुवंशिक अनुसंधान द्वारा खंडन किया गया है। जाहिर है, श्नौज़र के निकटतम पूर्वज दक्षिणी जर्मनी के तार-बालों वाले कुत्ते हैं, जिन्हें मध्य युग में उन जगहों के निवासियों द्वारा अपने घरों की रक्षा करने और कृन्तकों से लड़ने के लिए रखा जाता था, ठीक उसी तरह जैसे उस समय इंग्लैंड में टेरियर का उपयोग किया जाता था।
जर्मनी में लघु श्नौज़र के प्रजनन के बारे में पहली जानकारी 19 वीं शताब्दी के अंत की है। उनके पूर्वजों ने चूहों और अन्य परजीवियों के खिलाफ ग्रामीण खलिहान की रक्षा की। तत्कालीन प्रसिद्ध Mittelschnauzer की एक लघु प्रति बनाने के लिए, नस्ल के छोटे प्रतिनिधियों की कई पीढ़ियों को पार किया गया था। जब अन्य नस्लों, जैसे एफ़ेनपिंसर, पूडल, मिनिएचर पिंसर, स्पिट्ज के साथ पार किया गया, तो रंग एक साइड इफेक्ट के रूप में दिखाई दिए जो प्रजनकों के अंतिम लक्ष्य के अनुरूप नहीं थे, और जीन पूल को स्थिर करने के लिए, बहु-रंगीन और सफेद पिल्लों को बाहर रखा गया था। प्रजनन कार्यक्रमों से पहला लघु श्नौज़र 1888 में पंजीकृत किया गया था, पहली प्रदर्शनी 1899 में आयोजित की गई थी।