De Perdiguero de Burgos is al ieuwenlang yn Spanje fokt as oanwiishûn, mar de oarspronklike komôf is ûnbekend. Der wurdt fan útgien dat de Perdiguero de Burgos in krusing is tusken de Sabueso Español en de Pachon Iberico.
Yn 1911 waard it ras opnommen yn it Spaanske rasregister. Fan 1936 ôf krige de Perdiguero de Burgos itselde lot as in protte oare hûnerassen: it ras waard yn de Spaanske Boargeroarloch en de Twadde Wrâldoarloch suver útroege. Pas yn 1950 waard de Perdiguero de Burgos wer fokt.
Hjoed yn Dútslân is de Perdiguero de Burgos lykwols frij seldsum.