Husky helesinised silmad on pilkupüüdvad. Sinised silmad võivad olla ka ainult mõnel teisel koeratõul, nagu Austraalia lambakoer ja collie. Siberi huskyde puhul on teadlased nüüd kindlaks teinud, milleni nende värvus sageli viib. Selle järgi on tihe seos konkreetse piirkonna dubleerimisega kromosoomis 18. Koerte genoom jaguneb kokku 78 kromosoomi peale, millest 46 on inimestel ja 38 kassidel.
Mitmeid geenivariante, nagu nn merle faktor, mis põhjustab teatud koeratõugudel siniseid silmi, oli juba teada, kuid need ei mängi siberi huskyde puhul rolli. Adam Boyko ja Aaron Samsi juhitud meeskond Bostonis, Massachusettsis asuvast Embark Veterinaryst, koerte DNA-testide tarnijast, kaasas nüüd genoomianalüüsi rohkem kui 6,000 erineva silmavärviga koera.
Kromosoomi kahekordistunud piirkond on lähedane geenile ALX4, millel on oluline roll imetajate silmade arengus, teatavad teadlased ajakirjas PLOS Genetics. Kõigil geneetilise variandiga huskydel pole aga sinised silmad, seega peavad rolli mängima ka teised seni teadmata geneetilised või keskkonnategurid. Sageli on loomal üks pruun silm ja teine sinine.