Pekingeserracens historie er stadig skjult under et slør af hemmeligholdelse. Racens fødselsdato kan ikke engang bestemmes tilnærmelsesvis. Derfor var Pekingesernes oprindelse overgroet med legender og myter.
En af legenderne om Pekingeser-racens historie siger, at prinsen blev forelsket i en simpel pige. Men hendes skønhed betog også den onde troldmand. Da skønheden afviste troldmandens påstande, forvandlede han hende til en lotusblomst og prinsen til et egern. Deres kærlighed forsvandt dog ikke. Egernet passede ømt på blomsten. Da Buddha så dette, forbarmede sig og velsignede de elskende.
Kærlighedens frugt var Pekingeseren, hvis buskede hale ligner et egern, og hvis karakter og kropsbygning er en lotus ømhed og skrøbelighed.