Haskijeve jarko plave oči privlače poglede. Samo nekoliko drugih rasa pasa, kao što su australski ovčar i škotski ovčar, takođe mogu imati plave oči. Što se tiče sibirskih haskija, istraživači su sada utvrdili čemu često dovodi njihova obojenost. Prema tome, postoji bliska veza sa dupliciranjem određene regije na hromozomu 18. Genom pasa je raspoređen na ukupno 78 hromozoma, 46 kod ljudi i 38 kod mačaka.
Nekoliko varijanti gena, kao što je takozvani merle faktor koji uzrokuje plave oči kod određenih pasmina pasa, već je bilo poznato, ali one ne igraju ulogu kod sibirskih haskija. Tim koji predvode Adam Boyko i Aaron Sams iz Embark Veterinary u Bostonu, Massachusetts, dobavljač DNK testova za pse, sada je uključio više od 6,000 pasa različitih boja očiju u analizu genoma.
Udvostručeni region hromozoma je blizak genu ALX4, koji igra važnu ulogu u razvoju očiju kod sisara, izvještavaju istraživači u časopisu PLOS Genetics. Međutim, nemaju svi haskiji s genetskom varijantom plave oči, tako da drugi prethodno nepoznati genetski ili okolišni faktori također moraju igrati ulogu. Često životinja ima jedno smeđe oko, a drugo plavo.