Škotski terijer vjerojatno potječe od kratkonogih i vrlo grabežljivih lovačkih pasa koji su korišteni u sjeverozapadnoj Škotskoj, u visoravni oko okruga Perthshire, prvenstveno za lov na jazavce, lisice i divlje zečeve te za lov na vidre. Ovi vrlo mišićavi terijeri tog vremena vjerovatno su imali nešto duže noge od današnjih “Scottiesa”, kako je pasmina poznata.
#1 Pokazali su se hrabri i neustrašivi pred svojim dobro ojačanim plijenom, ali optički nisu imali mnogo zajedničkog sa današnjim standardom pasmine.
Baš kao i škotski terijer, tri druge vrste kratkonogih terijera Cairn, Skye i West Highland White Terrier vjerojatno se također vraćaju ovim originalnim škotskim lovačkim psima.
#2 Sredinom 19. stoljeća u škotskom gradu Aberdeenu započeo je ciljani uzgoj posebne rase terijera.
Već 1879. ovi psi, u to vrijeme još uglavnom sa tigrastom dlakom, prvi put su prikazani na izložbi pasa u Engleskoj. U početku je postojao spor oko toga koji od raznih terijera porijeklom iz Škotske može dobiti oznaku "škotski terijer".
#3 Osnivač Kluba škotskih terijera, kapetan Gordon Murray, međutim, uspio je da se afirmiše 1882. godine, i tako je “Aberdeen terijer” konačno postao “škotski terijer”.
Osnivanjem Kluba terijera u Njemačkoj 1894. godine konačno je uspostavljen uzgoj nove rase iu ovoj zemlji. Godine 1906. prvi štenci su upisani u rodovnu knjigu pod imenom "škotski terijer". Uglavnom mrkli terijer sa upečatljivom vanjštinom brzo je postao pravi modni pas.