Даследчыкі мяркуюць, што самаедскія лайкі жывуць побач з чалавекам каля трох тысяч гадоў, прычым у амаль нязменным выглядзе, так як асяроддзе іх пражывання абмежавана, а змешванне з іншымі сабакамі было немагчыма па аб'ектыўных прычынах.
Сваю назву парода атрымала ад назвы качавых плямёнаў паўночных раёнаў Урала і Сібіры, цяпер вядомых як ненцы. Гэтыя народнасці жылі асобна ад навакольнага свету і былі самадастатковымі, «самаяднанымі» — адсюль і назва. Не варта шукаць у слове «Самоед» нейкі «гастранамічны» адценне.
Эрнст Кілберн-Скот, брытанскі заолаг і аматар сабак, у канцы 19 стагоддзя прывёз з гэтых зямель у Лондан некалькі вядомых сабак. Сярод іх быў і вельмі вялікі беласнежны самец па імі Суйт. Менавіта з гэтага перыяду пачалася сучасная гісторыя пароды. У 1909 годзе Скот разам з жонкай адкрыў знакаміты і да гэтага часу гадавальнік «Фармінгем», а праз пару гадоў з'явіўся першы клуб аматараў незвычайных паўночных сабак. Тады ж быў вызначаны стандарт, які існуе нязменным больш за сто гадоў.